2015年11月6日，於Super Junior出道十週年之際，宣佈設立獨立工作室廠牌「Label SJ」，專屬負責其專輯製作、經紀管理等方面的事業。 由於組合人數眾多，成員亦各有所長，為了活動不受限制，涉足不同的音樂類型，自出道以來一共建立了五個子團體，在歌手、演員、主持、DJ及模特等多方面發展。 2019年7月11日，於Instagram中表示自己為團體帶來不少負面影響，對成員和粉絲感到抱歉，宣佈離隊退出。 superjuniorsuperclap superjuniorsuperclap 所屬公司Label SJ方面表示：「決定尊重強仁的退出意向，但本人與SM娛樂的專屬合約不變」。
- 2014年2月20日，神童、晟敏、銀赫、始源在韓國國會的議員會館擔當特別講師，代表SM娛樂進行演講，並以《感染世界的K-POP》為主題來講述從過去到現在進軍全球市場的過程與今後戰略，探討美術、音樂、舞蹈等公演產業和大眾音樂。
- 8月2日，Super Junior發行第五張正規專輯《Mr. Simple》，9月19日，發行改版專輯《A-Cha》。
- 12月7日，Super Junior第二張日語單曲專輯《Mr. Simple》發行。
- 專輯發行首日專輯銷量熱賣超過22萬張，創下唯一一組2000年代出道的韓國偶像團體，專輯初動達到20萬張以上的紀錄。
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12月17日，Super Junior發行第六張日語單曲專輯《Mamacita》。 11月20日，Super Junior為了兌現專輯銷售突破20萬的公約，於CJ電視購物頻道播出電視購物節目《Super Market》挑戰現場銷售黑色羽絨衣，成為韓國第一組登上購物臺的偶像團體。 11月28日，發行專輯《Play》的Pause版本，收錄Super Junior-K.R.Y.演唱的抒情曲《Shadowless》。12月6日，Super Junior發行第八張日語單曲專輯《On and superjuniorsuperclap On》。 12月15至17日，Super Junior在首爾蠶室室內體育館舉行巡迴演唱會《Super Show 7》，始源也回歸參與該演唱會。 Super Junior曾連續四年（2009年–2012年）獲得韓國唱片銷量總冠軍，並獲韓國金唱片獎三屆唱片大賞、五屆唱片本賞、七次人氣獎，是在韓國金唱片頒獎典禮獲得最多獎項的組合，同時為首個蟬聯金唱片大賞的團體。 2011年，Super Junior在Mnet亞洲音樂大獎獲得最佳男子團體、年度專輯大獎，並在韓國首爾歌謠大賞獲得大賞及本賞。
- 7月12日，Super Junior於吉達舉行《Super Show 7S》，成為首個在沙烏地阿拉伯舉行單獨演唱會的亞洲藝人。
- Super Junior作為第一隊將K-pop推向世界的組合，一直被傳媒冠稱為「韓流帝王」。
- 3月2日，Super Junior於首爾展開世界巡演安可場《Super Show 7S》，意為SS7的特別版演唱會。
- 8月12日，成員神童因健康問題，決定專心休養，暫停參與所有的活動，所主持的節目由成員銀赫代班，同年9月18日宣佈恢復健康復工。
- 舞蹈動作常著重於手部的變化，例如《Sorry, Sorry》的搓手舞、《Bonamana》的揮臂舞、《Mr. Simple》的甩手舞、《Sexy, Free & Single》的拍手舞、《MAMACITA》的頭痛舞及《SUPER Clap》的拍手舞。
- 2010年6月22日，韓庚以演員合約糾紛與SM達成和解而退出組合。
2010年6月22日，韓庚以演員合約糾紛與SM達成和解而退出組合。 2015年8月18日，起範因演員合約期滿而正式退出組合（2009年起即宣佈淡出）。 2017年起，成員強仁與晟敏因爭議糾紛暫時停止活動；該組合現以9人形式繼續活動。 Super Junior自2008年2月22日開始至2014年2月22日，透過3次亞洲巡演和2次世界巡演一共舉辦97場演唱會，觀眾人數累績至135萬人的紀錄。
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8月22日，Super Junior發行第四張日語單曲專輯《Sexy, Free & Single》，發行當日登上日本Oricon公信榜單曲日榜首位。 10月30日，成員利特以現役兵身分入伍服役21個月，由銀赫擔任臨時隊長。 2011年1月29日，利特和希澈率先從日本飛抵新加坡舉行「Super Show 3」亞洲巡迴演唱會，他們搭車前往飯店途中，在高速公路上被粉絲搭乘的車子追撞，造成前後共6輛車連環碰，幸他倆未有受傷，順利登臺。 2月24日，Super Junior第三次亞洲巡演《Super Show 3》3D電影在韓國上映。 6月8日，Super Junior首張日語單曲專輯《Bonamana》發行。
由於這起交通事故，他全身12處負傷、大腿骨骨折、腳裸骨折、盆骨骨折、膝蓋和股骨之間的胯骨嚴重受傷，爲保持清醒，咬住自己的舌頭，致使舌神經撕裂。 手術過程在他的股骨和膝蓋之間插入十幾釐米鋼釘，醫生建議希澈三個月內停止一切活動，期間如果進行劇烈運動仍會有骨折危險，而應該住院八週以上的希澈，只住院35天就出院了，其後腿內的鋼釘後來也因過度練舞而彎曲，需再度住院。 Coinbase：購買、管理和出售您的加密貨幣的一種簡單又安全的方式。
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此外，Super Junior也在金唱片獎獲得MV人氣獎與首爾歌謠大賞上獲得Mobile人氣獎。 2005年11月6日，Super Junior 12名成員以史無前例的超大型12人男團組合之姿正式出道，於SBS人氣歌謠首次登臺表演出道單曲《Twins 》。 12月5日，Super Junior發行首張正規專輯《Super Junior05》。 12月16日，Super Junior與東方神起共同發行聖誕合集《Show Me Your Love》。
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2014年度韓國音樂頒獎典禮上，Super Junior憑藉第七張正規專輯《Mamacita》，於韓國金唱片獎及首爾歌謠大賞上均獲得唱片部門本賞；於Gaon Chart K-POP大獎以正規七輯《Mamacita》及其改版專輯《This Is Love》獲得2014年第三季度專輯獎及第四季度專輯獎，此外也獲得微博K-POP Star獎。 2012年4月16日，成員強仁退伍完成兵役歸隊，成為組合內第一位完成兵役的成員。 5月9日，Super Junior第三張日語單曲專輯《Opera》發行，奪得了當天日本Oricon公信榜銷量榜的冠軍。 2010年5月13日，Super Junior發行第四張正規專輯《Bonamana》，6月28日發行改版專輯《No Other》。 8月14日，第三次亞洲巡迴演唱會《Super Show 3》開始。 superjuniorsuperclap2025 出道時，由利特、希澈、韓庚（中國籍）、藝聲、強仁、神童、晟敏、銀赫、東海、始源、厲旭及起範（美國籍）共12名成員組成。
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2014年8月29日，正式發行第七張正規專輯《Mamacita》。 這次專輯發佈後隨即登上iTunes亞洲4個地區的專輯排行榜的榜首，躋身歐洲、南美等世界各國專輯排行榜的前列，成功橫掃YouTube官方K-POP頻道及中國愛奇藝、音悅臺V榜等各種MV排行榜的冠軍，全球韓流帝王Super Junior的地位再次獲得證明。 9月13日，美國billboard（公告牌）發佈的「World Albums（世界專輯排行榜）」中，Super Junior憑著《Mamacita》獲得第一。 第七張正規專輯《Mamacita》的唱片在9月1日公開發售後，連續2週登上Gaon Chart週榜冠軍。 12月13日，成員晟敏與藝人金思垠舉辦不公開婚禮，成為組合內第一位結婚的成員。
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其經紀公司SM娛樂宣佈Super Junior未來將有可能組成更多的子團體。 這種音樂通常由各種樂器混合，並強調容易記憶的旋律，從第三張專輯開始，確立「SJ Funky」的曲風。 神童、起範、銀赫是主要的Rapper，利特、希澈、東海在某些歌曲中也常加入支援Rap。 在起範離隊後，Rapper主要以銀赫、神童、利特、希澈、東海為主。
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2019年5月7日，成員圭賢完成兵役退伍歸隊，也是組合內最後一位完成服兵役的成員，Super Junior長達九年的兵役期正式結束，成為韓國全員役畢偶像組合之一。 6月3日，Label SJ公佈SJ將為下半年回歸歌壇準備，該作品為全員結束兵役後的首張專輯，而強仁及晟敏確定不參與組合的第九張正規專輯活動。 2017年度韓國音樂頒獎典禮上，Super Junior憑藉第八張正規專輯《Play》於韓國金唱片獎及首爾歌謠大賞均獲得唱片部門本賞獎項；也在亞洲明星盛典中獲得Fabulous獎及Legend獎。 Super Junior本屬韓國SM娛樂所推出的實驗性限定組合，「本來只計劃進行為期3個月的活動，然後就解散、各走各的路」。 第一張專輯宣傳結束後，SM娛樂開始物色新成員替換舊成員，產生新一代「Super Junior 06」以履行「Super Junior 05」計劃，甚至已準備新成員名單，但在2006年5月27日，公司宣佈沒有成員需要退出組合，反而加入新成員圭賢，從此替換成員計劃結束，隊名正式改為Super Junior，成為固定13人的男子組合。
superjuniorsuperclap: Super Junior歡慶14週年！官方發圖「金希澈被消失」只有8人 粉絲氣炸洗版
11月1日，Super Junior第五張正規專輯主打歌《Mr. Simple》MV觀看次數突破一億，成為Super Junior首支破億MV，亦為SM娛樂旗下男團中MV點擊首度破億團體 。 11月6日，韓國SM娛樂在Super Junior出道十週年之際，為組合設立獨立工作室廠牌《Label SJ》，全面經營Super Junior的個人、小組、團隊活動，專屬負責其專輯製作、經紀管理等方面的事業，開創韓國業界的先例。 2014年2月20日，神童、晟敏、銀赫、始源在韓國國會的議員會館擔當特別講師，代表SM娛樂進行演講，並以《感染世界的K-POP》為主題來講述從過去到現在進軍全球市場的過程與今後戰略，探討美術、音樂、舞蹈等公演產業和大眾音樂。 2006年度韓國音樂頒獎典禮上，Super Junior憑藉《U》於韓國金唱片獎、首爾歌謠大賞、MKMF音樂頒獎禮、SBS歌謠大賞及MBC歌謠大賞均獲得新人賞。
10月8日，發行特別迷你專輯《One More Time》，公開專輯完整音源及同名主打歌MV，並於MV拍攝地點澳門美獅美高梅酒店舉行回歸Showcase，該張專輯共收錄五首歌曲，同名主打歌是與南美洲著名的墨西哥樂團Reik合作的拉丁曲風。 該專輯為厲旭退伍復出後的首張作品，希澈因腳傷問題只參與MV及專輯概念照拍攝，不參與專輯錄製及宣傳活動，則圭賢因入伍服役、強仁因酒駕自省中、晟敏因與粉絲溝通不良，均不參與該專輯的活動。 11月5日，Super Junior真人秀節目《SJ Returns 2》正式播出。
最終以主頻道 hearts 數超13億，所有頻道總 hearts 數超28億的成績創造紀錄。 2016年1月6日，Super Junior第七張日語單曲專輯《Devil / Magic》正式發行。 10月11日，成員厲旭以現役兵身份入伍服役，基礎訓練後被分配至軍樂團以國樂兵的身分繼續服役。
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Super Junior官方微博4日早上9點40分寫下：「今日（11／06），SuperJunior出道14週年！第9張正規專輯特別版《TIMELINE》發行!通過應用程序Lysn進行出道14週年網絡接力聊天活動！」並特別附上成員們的照片，但圖片中的人僅有利特、藝聲、神童、銀赫、東海、始源、圭賢和厲旭，共8人的照片引起粉絲不滿。 起範在參加完2009年3月7日的Super Show演唱會完後宣佈解除SM唱片合約，並暫停參與Super Junior團體歌唱及唱片宣傳活動，並專注戲劇發展，並且表示自己還是Super Junior的成員。 到2015年8月18日演員合約期滿，正式離開SM經紀公司並退出Super Junior。 Super Junior善用團員人數眾多這一特點，強調整體的隊形複雜的舞蹈編排。 韓庚、神童、銀赫、東海為公認的四大領舞，在韓庚離隊退出後，利特、晟敏、圭賢在四輯之後亦成為副領舞。 特別是銀赫作為第一領舞者，有獨舞的橋段，於SM娛樂公司七大男團主舞之一，是公認的韓國最佳舞蹈藝人之一，舞蹈實力在韓國藝人圈名列前茅，有「舞王」、「跳舞機器」等封號。
2019年1月26日，Super Junior受邀前往臺北參加第14屆KKBOX風雲榜，成為首位非華語歌手獲獎年度風雲歌手。 3月2日，Super Junior於首爾展開世界巡演安可場《Super Show 7S》，意為SS7的特別版演唱會。 2015年8月18日，起範與SM娛樂演員合約期滿，離開公司並同時退出Super Junior。 10月13日，成員銀赫以陸軍現役身份入伍服役21個月，同月15日成員東海以義務警察身份入伍服役21個月。 2015年3月24日，成員神童以現役兵身份入伍服役，成員晟敏也於同月31日以現役兵身分入伍服役。
2009年12月21日，韓庚向首爾中央地方法院請求判決與SM娛樂的《專屬合同》無效。 原因是基於收入分配不公及工作過密導致過勞，並公開合約內的6點不公平條約。 南韓首爾中央法院2010年12月21日宣判韓庚與SM娛樂陸續簽的合約等都是不平等條約、沒有法律效力，韓庚勝訴，解除與公司的任何關係。
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2011年9月21日，韓庚提出撤銷專屬合約效力不存在確認請求訴訟，雙方訴訟事件就此結束。 韓團Super Junior今年終於迎接全員退伍的喜悅，於6日是出道14週年紀念，怎料卻因為官方微博放的圖讓大陸網友深感不滿，底下的留言比起祝福更多的是抗議聲。 2007年7月26日，Super Junior全體成員拍攝的首部喜劇電影《花美男連鎖恐怖事件》在韓國首映，講述各高中第一美少年所遭遇的連續恐怖事件，並解決事件。 9月11日，Super Junior主演與申東燁主持的綜藝節目《人體探險隊》於SBS頻道正式播出。 8月10日，成員希澈從木浦參加成員東海父親的葬禮後，趕回首爾途中，在忠清道發生嚴重車禍。
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11月10日，強仁、銀赫、始源和圭賢在英國牛津大學進行演講，談及製作唱片的過程及對韓流的認知等話題，吸引近400名聽眾。 12月11日，Super Junior發行第五張日語單曲專輯《Blue World》。 2007年度韓國音樂頒獎典禮上，Super Junior憑藉《Don’t Don》獲得MKMF音樂頒獎禮年度歌手大獎及韓國金唱片獎和首爾歌謠大賞的唱片本賞。 2019年度韓國音樂頒獎典禮上，Super Junior憑藉第九張正規專輯《Time_Slip》於韓國金唱片獎及首爾歌謠大賞中獲得唱片部門本賞獎項，在亞洲明星盛典中獲得人氣獎及AAA Top of K-pop Record獎。 11月19日，世界巡迴演唱會《Super Show 4》開始，隨後於中國、日本、法國等國的10個城市舉辦共24場演唱會，此巡演讓Super Junior成為首個在巴黎舉行單獨演唱會的韓國歌手。 12月7日，Super Junior第二張日語單曲專輯《Mr. Simple》發行。